| 平成１年１１月２日→ 木曜よる７時３０分 | ||
| 1A | エリさま、おめでとう | 11/2 |
| 1B | おもちゃもラーメンを食べる | 11/2 |
| 2A | エリさま花のように | 11/9 |
| 2B | 御先祖は日本王！？ | 11/9 |
| 3A | チンプイ疲れはてる | 11/16 |
| 3B | 科法使いエリさま | 11/16 |
| 4A | ワンダユウの陰謀 | 11/23 |
| 4B | シースルーシール | 11/23 |
| 5A | 黄金伝説 | 11/30 |
| 5B | エリさまベーカリー | 11/30 |
| 6A | ぬいぐるみにコンピューター | 12/14 |
| 6B | エリさまが主役だ | 12/14 |
| 7A | エリさまが家出をされた | 12/21 |
| 7B | おかしなクリスマス | 12/21 |
| SPA | 宇宙的超一流デザイナー | 12/29 |
| SPB | エリさまはキョーボー？ | 12/29 |
| 平成２年 | ||
| 8A | 願いごとかなえ券 | 1/11 |
| 8B | マフラーは誰のもの | 1/11 |
| 9A | 立体映像の使い道 | 1/18 |
| 9B | 夢で会いましょう | 1/18 |
| 10A | 天才画家エリさま | 1/25 |
| 10B | マジローの逆襲？ | 1/25 |
| 11A | 男の子になりたい | 2/1 |
| 11B | おそれながら健康診断 | 2/1 |
| 12A | エリさまご見学ツアー | 2/8 |
| 12B | エリさまお許しを | 2/8 |
☆
| 13A | ウルトラギャル | 2/15 |
| 13B | ライバルかんげいします | 2/15 |
| 14A | 危険！タイムトラベル・前編 | 2/22 |
| 14B | 危険！タイムトラベル・後編 | 2/22 |
| 15A | ワンダユウは占い師？ | 3/1 |
| 15B | エリさまは美少女 | 3/1 |
| 16A | 科法スキー大作戦 | 3/8 |
| 16B | パーピーハウス | 3/8 |
| 17A | 勇士レピと勇士エリ | 3/15 |
| 17B | くじけていただきます | 3/15 |
| 18A | ふしぎな温泉旅行・前編 | 3/22 |
| 18B | ふしぎな温泉旅行・後編 | 3/22 |
| 19A | エリさま初レコーディング・前編 | 4/19 |
| 19B | エリさま初レコーディング・後編 | 4/19 |
| 20A | ラッキーペンダントでスターに | 4/26 |
| 20B | ブルル提督の挑戦 | 4/26 |
| 21A | すてきな星に新築計画？ | 5/3 |
| 21B | パリのエリおばさま | 5/3 |
| 22A | ピヨピヨ募金会名誉総裁に | 5/10 |
| 22B | どうにもこうにも | 5/10 |
| 23A | エリさまはニンジン嫌い | 5/17 |
| 23B | 科法ゴーホーム作戦 | 5/17 |
| 24A | エリ＆チンプイカンパニー | 5/24 |
| 24B | 海中撮影したけれど | 5/24 |
☆
| 25A | おしゃぶり探偵エリ | 5/31 |
| 25B | 見てしまった結婚式 | 5/31 |
| 26A | あの子はだあれ？ | 6/7 |
| 26B | シンデレラの靴 | 6/7 |
| 27A | 温室効果ビームで大切に・前編 | 6/21 |
| 27B | 温室効果ビームで大切に・後編 | 6/21 |
| 28A | 見つかった宇宙人の秘密基地！？ | 6/28 |
| 28B | ジャラシーが来た | 6/28 |
| 29A | マールい物こわい！ | 7/12 |
| 29B | エリさまホレルヤ | 7/12 |
| 30A | 殿下に負ないで | 7/26 |
| 30B | 天体観測で見つけたものは | 7/26 |
| 31A | マイケルのホームコンサート | 8/2 |
| 31B | シャッターチャンスを狙え | 8/2 |
| 32A | また来たジャラシー | 8/9 |
| 32B | お妃候補ほたるさま | 8/9 |
| 33A | ホロロンってだあーれ？ | 8/16 |
| 33B | ベビーシッターエリちゃん | 8/16 |
| 34A | 惑星シュミレーター・前編 | 8/23 |
| 34B | 惑星シュミレーター・後編 | 8/23 |
| 35A | 謎の美少女を探せ | 9/6 |
| 35B | 戦国探検隊 | 9/6 |
| 36A | 黒い秘密警護官 | 9/20 |
| 36B | エリさまガーデン | 9/20 |
☆
| SP | 藤子・Ｆ・ファンタジースペシャル 映画チンプイ・エリさま活動大写真 | 10/11 |
| 37A | 私を科法で病気にして！！ | 10/18 |
| 37B | エリさまは旅行中 | 10/18 |
| 38A | 小遣い不足の億万長者 | 11/1 |
| 38B | ライバル強化指令 | 11/1 |
| 39A | プレゼントをもらえ | 11/8 |
| 39B | ビックリ結婚占い | 11/8 |
| 40A | 約束固めマイク | 11/15 |
| 40B | お姉さんがやってきた | 11/15 |
| 41A | パパ、念願の運転免許 | 11/22 |
| 41B | スクープを狙え！ | 11/22 |
| 42A | 内木君大変身 | 11/29 |
| 42B | 殿下の顔はどんな顔 | 11/29 |
| 43A | スケジューラーでパパパッと | 12/13 |
| 43B | 大江山の悪だくみ | 12/13 |
| 44A | なにしにきたんだろ | 12/20 |
| 44B | パーティの後で | 12/20 |
| 平成３年 | ||
| 45A | わらべ歌の秘宝・前編 | 1/10 |
| 45B | わらべ歌の秘宝・後編 | 1/10 |
| 46A | エリさま出生の秘密 | 2/21※ |
| 46B | さよならはイヤ | 2/21※ |
| 47A | 透明キャップ | 1/24 |
| 47B | エリさまがいっぱい | 1/24 |
| 48A | ワンダユウの人事異動 | 1/31 |
| 48B | 別荘星はいかが！ | 1/31 |
※第４６回は湾岸戦争ニュースのため、放送日延期 2/21に放送
☆
| 49A | 時空転送！彗星ＳＯＳ・前編 | 2/7 |
| 49B | 時空転送！彗星ＳＯＳ・後編 | 2/7 |
| 50A | 科法断食祭 | 2/14 |
| 50B | 素敵なバレンタインデー | 2/14 |
| 51A | またまたマジローの逆襲 | 2/28 |
| 51B | ベストセラーお願いします | 2/28 |
| 52A | ＧＯＧＯニセモノ大作戦 | 3/7 |
| 52B | わかがえりマッチ | 3/7 |
| 53A | おかしなゴリラ探しツアー | 3/14 |
| 53B | バブバブの唄が聴こえる | 3/14 |
| 54A | 宇宙迷子ワケナイ | 3/21 |
| 54B | 結ばれたさやかと内木 | 3/21 |
| 55A | 名画獲得作戦 | 4/11 |
| 55B | マール星財産の使い道 | 4/11 |
| 56A | レッツゴー銀河レース | 4/18 |
| 56B | はじめまして、ルルロフです | 4/18 |